1.洗滌步驟：

洗滌對于整個提取步驟至關重要，關系到核酸的純度，核酸的純度直接影響下游 PCR應用。磁棒的振蕩幅度和混合時間會影響洗滌效率。磁棒振蕩幅度太小或混合時間太短，有雜質殘留在磁珠上會影響磁珠吸附核酸的能力。振蕩太劇烈或時間太長，會丟失部分核酸或造成核酸的斷裂、降解，得率下降。

2.裂解步驟：

樣本裂解是核酸提取過程中很關鍵的一步，只有充分裂解了細胞或病原體，才能釋放里面的核酸。

磁珠結合效率決定了有多少核酸可以吸附到磁珠上，即洗脫核酸的上限。影響結合效率的因素有磁珠的吸附能力以及結合緩沖液的結合能力。

3.洗脫步驟：

洗脫步驟直接影響核酸得率，影響洗脫效率的因素有磁珠的干燥程度以及洗脫溫度和時間。磁珠未充分晾干，可能會有醇類等雜質殘留，影響后續 PCR 反應；磁珠過分干燥，核酸可能會干結在磁珠上，導致洗脫效率下降。適當提高洗脫溫度和時間，有利于核酸從磁珠上游離下來，時間過長或溫度過高，核酸有可能會降解，需要把握其中的平衡。